در پی شهادت سرافرازانه قائد امت حضرت امام خامنهای مردم انقلابی و ولایتمدار قم لبیک یا حسین گویان در حرم حضرت معصومه سلام الله علیها به سوگواری پرداختند.
آیت الله نوری همدانی در پیامی اعلام کرد: شهادت رهبر حکیم و شجاع انقلاب اسلامی ایران حضرت آیت الله خامنهای «رضواناللهتعالیعلیه» پاداش یک عمر اخلاص و مجاهدت و بندگی بود.
فرماندهی کل انتظامی جمهوری اسلامی با صدور پیامی ضمن تبریک و تسلیت شهادت حضرت آیتالله العظمی خامنهای، بر ادامه راه نورانی آن رهبر فرزانه تا فتح و نصرت نهایی تاکید کرد.
جنبش مجاهدین فلسطین و شاخه نظامی آن، گردانهای مجاهدین، شهادت حضرت آیت الله امام سید علی خامنهای رهبر معظم انقلاب اسلامی ایران را که در ماه مبارک رمضان و در پی بمباران صهیونیستی-آمریکایی علیه جمهوری اسلامی ایران به مقام رفیع شهادت نائل آمد، تسلیت گفت.
رئیس قوه قضاییه طی پیامی شهادت قائد امت، حضرت آیتاللهالعظمی امام خامنهای (قدس سره) را به محضر حضرت بقیةاللهالاعظم ارواحنافداه و ملت ایران و همه مسلمانان و آزادیخواهان جهان تسلیت گفت.
شورای هماهنگی تبلیغات اسلامی در پی شهادت رهبر انقلاب اعلام کرد: ملت ایران در سوگ امام خویش با حرکت از مساجد و حسینیهها در قالب دستجات عزاداری در خیابانها و میادین اصلی شهرها حضور مییایند.